街では今日も“外来獣”が出現!! 転校してきた女子高校生・南良原ナユナは、ある日の放課後、地面を潜る地底型外来獣に遭遇してしまう。
ガタガタと震えるナユナ。だが目の前で怪獣が倒れ、お腹の中から、ちっちゃくて細い女の子が現れた。…竜使いハンター、名前はサラ。
運命の出会いから数日後、ナユナは“怪獣撃退部”に入部する決心をして――。